DNA

DNA

Terdiri dari 2 rantai polinuklotida (saling antipararel), membentuk double helix.

Basa nitrogen : adenin & guanin (purin), sitosin & timin (pirimidin)

Gula pentosa : deoksiribosa

Struktur primer : basa nitrogen dihubungkan kovalen dengan gula pentosa -> nukleosida

Nukleosida + fosfat = nukleotida

Struktur sekunder : 2 rantai dihubungkan dengan ikatan hidrogen pada pasangan basa nitrogennya. A = T, G = C. Double helix memiliki major dan minor groove sehingga ada jenis DNA A, B, Z.

Denaturasi -> pemutusan ikatan hidrogen dengan pemanasan dan perombakan alkali

Renaturasi -> pembentukan kembali ikatan hidrogen

Organisasi DNA

· Prokariot : DNA sirkuler (plasmid)

· Eukariot : Protein-protein histon membentuk octamer yang akan dikelilingi DNA -> nucleosom. Nucleosom + protein histon 1 (H1) = kromatosom. Nucleosom -> Selenoida -> benang-benag kromatin -> kromosom.

Modifikasi DNA

Asetilasi : akan mengahalangi pelekatan molekul DNA pada histon, sehingga mengurangi DNA yang berkondensasi dan memudahkan terjadinya transkripsi.

Telomer : Strukture khusu pada ujung kromosom -> pengulangan skuen TTAGGG. Fungsi : menjaga ujung kromosom dari rekombinasi, fusi, dan kerusakan.

Replikasi DNA

Replikasi : proses menyalin urutan basa nitrogen pada DNA induk sehingga terbentuk duplikasi pada DNA anak.

Protein yang berperan : Helikase, ssBP, DNA polimerase I dan III, primase, ligase, girase.

Semikonservatif : DNA baru berpasangan dengan DNA lama.

Langkah-langkah replikasi :

1. Replikasi dimulai dari daerah tertentu pada DNA, yang disebut ori. 2 untaian DNA akan dibuka (unwind) oleh protein helikase, tempat pembukaan dinamai garpu.

2. Replikasi (replication fork)

3. Protein ssBP (single-strand binding protein) menjaga agar ke 2 rantai tak menyatu kembali

4. Protein primase mensintesis RNA primer

5. DNA polimerase III menambahh nukleotida sesuai dengan tempelate DNA.

a. Leading Strand : Direplikasi secara langsung.

b. Lagging Strand : Direplikasi secara terputus-putus membentuk fragmen okazaki

6. RNA primer dihancurkan dan diganti dengan DNA oleh DNA polimerase I

a. Pada lagging strand : fragmen okazaki disambung oleh protein ligase

7. Girase merenggangkan rantai double helix yang makin kaku pada daerah yang belum direplikasi